第一次
医院屋顶，被卡卡西拦下
第107集 想和你比试!终于对峙 佐助vs鸣人
第二次
佐助夺回战，终结之谷，鸣人输了，佐助离去
128-134集
第三次
佐助杀死团藏后，小樱去杀佐助，鸣人干到救了小樱，短暂交手，佐助随阿飞离去
第435话 两人的宿命
第四次
最后一次，封印辉夜后两人去终结之谷再次交手，平手，各失去一条手臂
第695话
六道仙人希望两人能同心协力，解开无限月读，但佐助却突然宣称自己要发动“革命”。鸣人、佐助重返终结之谷对决，经过一番大战之后，以两人各断一臂收场。佐助终于认同了鸣人的道路，承认败给鸣人，随后二人解开无限月读。
大战结束，但佐助并未就此和鸣人一起解除无限月读，而是扬言要将现任五影处以极刑，接着使用幻术和地爆天星封印了九大尾兽。鸣人决定出面制止佐助，两人前往终末之谷展开宿命的最终决战。佐助否认了鸣人追求和平的方式，认为要真正实现和平，应独自背负着全世界的仇恨，使忍界有一个公敌，才能让人们团结起来。而鸣人是他现存唯一的羁绊。只有亲手杀死鸣人，才能完成他的这一目标。
经过一天一夜的激烈鏖战，二人均失去了半只手臂，而且都身受重伤不支倒地。面对如此坚持制止他的鸣人，佐助表示自己对于鸣人的做法感到疑惑不解，自己也想自我了结来赎罪，鸣人则告诉佐助自己早已将他视为朋友，所以无论如何都会分担他的痛苦，阻止他身陷泥沼。佐助继而回忆起迄今为止和鸣人邂逅的点点滴滴，最后笑着承认鸣人才是这场对决里真正的赢家。
之后樱和卡卡西抵达终末之谷，为重伤倒地的二人疗伤。佐助首次坦然接受内心感情，为先前所铸下的错误向樱致歉，并且和鸣人一起解开了无限月读，救出了深陷幻术中的世人。
返回村里休养直至康复后，佐助告知卡卡西和樱他即将再度启程，远行他方看一看曾经因为自己被仇恨蒙蔽了双眼而错过的人和事。佐助婉拒了樱希望与之同行的请求，并答应自己会再度归来。才离村没多久，鸣人出现在佐助的面前，交还当初被自己用螺旋丸划过的木叶护额。佐助收下护额，承诺履行忍者的职责，两人就此告别。
鸣人vs佐助在第几集 扩展
一共有四次，具体来说是以下部分：
第一次：
第107集 想和你比试!终于对峙 佐助vs鸣人
第108集 看不见的裂缝
人互相猛烈攻击，最后鸣人和佐助分别使出绝招螺丝丸和千鸟。在已经无法停止使出这两招忍术的时候，小樱冲到两人之中。接着，在千钧一发之际，卡卡西出手阻止了二人。
第二次：
第128集 给我停下来 佐助！终于追上了佐助 大爆发
第129集 鼬和佐助 隔若天涯的存在
第130集 父与子 家徽的裂纹
第131集 开眼 万花筒写轮眼的秘密
第132集 朋友
第133集 泪的咆哮 你是我的朋友
第134集 泪雨的终结
佐助胜利，然后佐助投奔大蛇丸
第三次：
第435集 两人的宿命
佐助杀死团藏后，小樱去杀佐助，鸣人干到救了小樱，短暂交手，佐助随阿飞离去。
第四次：
第695话 终末之谷
第697话 鸣人与佐助
第697话 鸣人与佐助
第698话 和解之印
最后一次，封印辉夜后两人去终结之谷再次交手，平手，各失去一条手臂。
